《信蜂》的故事发生在没有太阳的地区“安帕葛兰多”，有种职业是专为住在连人工太阳也照射不到的危险地区的人们送信，他们赌上性命将人们托付他们的“心”努力送达，这群人被称为“信蜂”。主人公名为拉格·辛谷(拉格·西恩），属阿尔卑斯种，小时候是一名爱哭虫，拥有“琥珀之眼”，7岁时母亲被不明来历的男人带走，他12岁通过了试验并以最强信蜂“Head Bee”为目标展开旅程。

有一天，拉格受到了馆长的委托，内容是将信件传递到名为艾丽娜·布朗的女性那里。在达温的引路下，拉格和妮琪到达了目的地，而出现在他们面前的是……