北京积水潭医院重点学科突出，科室结构齐全，医学人才济济，骨科、烧伤医学技术达到世界及国内领先水平。医院设有北京市创伤骨科研究所、北京市烧伤研究所，北京市手外科研究所、北京创伤烧伤抢救中心、北京市骨科疾病研究治疗中心。全国计算机辅助外科学会和计算机辅助外科研究和应用中心也设在该院。中国第一个“骨科培训中心”于2001年4月27日在北京积水潭医院成立。2006年7月，北京积水潭医院被中国奥委会授予“国家队运动员指定医院”称号。该院回龙观院区内外妇儿俱全、门急诊俱备，床位500张，将于2009年完工。

北京积水潭医院建院50年来，在复杂的创伤骨折抢救、陈旧骨折不愈合手术治疗、断指断肢再植、拇指(趾)重建、骨肿瘤治疗、膝、肩关节镜下手术、人工关节置换、儿童(14岁以下)创伤及先天性骨病、颈椎病、腰腿痛的治疗，包括人工间盘置换、计算机导航手术仪、微创手术等技术应用、特大面积烧伤抢救、深度烧伤创面修复、电烧伤、骨代谢疾患的研究方面成果显著，曾获五项国家级成果奖。

北京积水潭医院是北京大学第四临床医学院。作为一所教学临床医院，各临床科室设备齐全、实力雄厚，骨科、烧伤科、 内科、外科、妇产科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、皮肤性病科、中医内科、中医正骨科、针灸科、理疗康复科等科室均具有很强的医疗技术力量。医院拥有大型医疗设备：CR(计算机照相)、DR(数字照相)X光机、螺旋CT、ECT(核素显像)、核磁、G型臂手术台、、计算机导航手术仪、各种关节镜、腹腔镜、盆腔镜、微创剖析手术仪、数字减影血管造影仪、高压氧舱等高科技医疗设备。