北京中医药大学附属东直门医院兼为我校临床医学院、临床医学研究所，1994年被评为全国三级甲等中医院和全国示范中医院，卫生部临床药理基地，全国中医急诊医疗中心，全院有574张病床，包括 急诊、内、外、妇、儿、针灸、骨伤、皮肤、推拿、眼科、耳鼻喉、口腔、乳腺、肿瘤、麻醉、理疗等26 个临床科室，8个医技科室，17个教研室，8个临床研究室，121个专科专病门诊，还设有ICU、CCU病 房。

该院中医内科为国家级重点学科。内科又分为心血管、脑病、消化、呼吸、热病、内分泌、血液、老年 等8个二级学科。外科也是国家重点学科，分设脑外、腔镜外科、肛肠科、周围血管病、男科、疮疡、 泌尿等二级学科，目前正筹备组建胸外科。 该院所属的全国中医急诊医疗中心，通过积极引进和开展新技术和新项目，不断提高整体医疗水平。

目前开展了心脏血流动力学监测，经胸壁、食道及心内膜下心脏起搏术;采用中药配合溶栓治疗急性心肌 梗塞和脑梗塞，副作用小，再通率高;中西医结合治疗中风病、热病、心绞痛、多脏器衰竭等病症，取 得了很好疗效，如首创通腑化痰、清热解毒、化痰通络、破血逐瘀、泻热醒神、化痰开窍法治疗中风急 症，被列入国家重点攻关课题，研究成果获国家科技进步奖。