丹顶鹤的栖息地是丹顶鹤栖息于开阔平原、沼泽、湖泊、海滩及近水滩涂。成对或结小群，迁徙时集大群，日行性，性机警，活动或休息时均有只鸟作哨兵。

中国在丹顶鹤等鹤类的繁殖区和越冬区建立了扎龙、向海、盐城等一批自然保护区。在江苏省盐城自然保护区，越冬的丹顶鹤最多一年达600多只，成为世界上现知数量最多的越冬栖息地。北京动物园1954年首次饲养展出丹顶鹤，1964年繁殖成功。

在中国东北和远东地区人类活动对湿地的破坏在1960年代以后急剧加重，对湿地的围垦不仅侵占了原有的栖息地，还使原本连通的水系阻断，再加上近些年远东地区气候干旱化趋势明显，水域面积缩小严重。人类活动引入的污染也威胁着丹顶鹤的生存，此外如烧荒等开垦方法，对丹顶鹤的巢材和掩蔽处毁坏严重，致使其分布更为狭窄。

由于自古东亚地区对丹顶鹤就有着对其羽毛和器官的需求，猎杀就难以避免。虽然近些年随着保护法规的建立，直接的猎杀很少发生，但是投毒用来猎捕其他水禽的方法，已成为丹顶鹤的重要死因。