《瘦马御史》是中国京剧院据云南同名滇剧移植而成的新戏，反映的是乾隆年间以钱南园为首的清官与腐败势力进行的一场斗智斗勇的较量。“瘦马御史”指的是清乾隆年间的监察御史钱沣（字南园），他常骑瘦马，一生清廉，擅写字、画马，故有此雅号。

清乾隆年间，监察御史钱南园〔钱沣〕，保奏好友御史浦霖，免于弹劾之罪，奉诏随钦差军机大臣和珅，并令其折罪的浦霖同去山东济南，查钱沣弹劾山东巡抚国泰、布政使于易简国库亏空一案。浦霖之妹莲心，执意随兄一同前往。

钱沣常骑瘦马，一身清廉，善写字、画马。丧妻多年，对母竭尽其孝，此去前途未卜，命仆人阿长借钱为老母安排日后生活，与母挥泪离别，钱母申明大义，嘱托儿子放心前去，完成圣命。

和珅倚仗皇威，与国泰、于易简相互勾结，贪污国库银两，为逃避钱的查案，设计充填库银，强逼师爷做下假帐，并毒死师爷，为钱沣查案设下重重障碍。钱沣不畏权势，微服私访，从“醉八仙”酒店店主口中探得真情。师爷之妻李氏为保真帐四处躲藏，钱命阿长暗中保护。莲心对钱沣暗生爱慕，向钱求“瘦马图”，钱沣深知宦海风云莫测，只能婉拒莲心的一年爱恋之情。

和珅、国泰用金钱、官爵及莲心的性命逼迫浦霖走上变节贼船，钱沣悲愤交加，面临杀头之祸，在莲心、李氏的帮助下，终于查明案情。国泰、于易简就地正法，浦霖无颜面对朋友、妹妹，自刎而死。和珅金蝉脱壳，“凯旋”而归。钱南园将“瘦马图”赠与莲心，一同回京复命。